在一项新的研究中,来自美国波士顿儿童医院的研究人员了解了更多关于V(D)J重组的过程,以及如何利用染色质成环(chromatin looping)来收集将要剪接的片段。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“Fundamental roles of chromatin loop extrusion in antibody class switching”。在这篇论文中,这些研究人员概述了他们的研究以及他们所了解的免疫细胞匹配遗传密码片段来产生新型抗体的方法。
图片来自Nature, 2019, doi:10.1038/d41586-019-03200-4。
 
正如这些研究人员所指出的那样,许多研究工作已经投入到了解人类免疫系统是如何发挥作用的。一项发现是当发现新的威胁时,免疫细胞可将遗传密码的某些片段混合和匹配,从而产生新的抗体。但是直到现在,这种混合和匹配过程还是一个谜。在这项新的研究中,这些研究人员着手进一步了解它的工作机制。
 
这些研究人员一开始就知道V(D)J重组过程会让免疫系统产生新的抗体。他们还指出,DNA链与蛋白一起包装成含有有多个环的染色质。当身体检测到新的威胁时,染色质中的这些环会将远处的DNA片段拉近。
 
这项研究展示了B细胞如何利用染色质中的环形成来产生新的抗体。他们发现RAG酶与参与启动V(D)J重组第一步的机制偶联在一起,从而迫使D和J连接在一起。接下来,当形成环时,DNA越过RAG复合物。与此同时,其他因素也阻止了环挤压(loop extrusion),这会暂停DNA移动,从而允许RAG进入。这允许将基因底物片段呈递给RAG复合物以进行V(D)J重组。他们还发现一种叫做黏连蛋白(cohesin)的蛋白参与了这种环挤压/RAG过程。他们还指出,尽管他们的研究工作集中在V(D)J重组过程上,但是他们相信他们的发现将对基因调控中涉及的其他过程产生影响。
 
参考资料:
 
1.Xuefei Zhang et al. Fundamental roles of chromatin loop extrusion in antibody class switching. Nature, 2019, doi:10.1038/s41586-019-1723-0.
 
2.Study reveals more about how immune cells create new types of antibodies
https://medicalxpress.com/news/2019-10-reveals-immune-cells-antibodies.html